Le Conseil général prend en charge la totalité des dépenses de fonctionnement des 37 collèges publics en Deux-Sèvres. En 2008, c'est plus de 3,5M€ qui sont versés aux établissements pour le financement de la viabilisation et des besoins pédagogiques.
Par ailleurs, le Département soutient des projets fédérateurs initiés dans le cadre de projets d'établissements.
